中国大陆重庆市公安局星期二（10月28日）发布警情通报，指台湾民进党立委沈伯洋通过发起、建立台独分裂组织“黑熊学院”等方式，从事分裂国家犯罪活动，决定依法追究其刑事责任。台湾政府的大陆委员会则反驳，称中共对台没有管辖权，其法律与规范对台湾人毫无拘束力。
沈伯洋透过脸书回应说：“下一步大概就是通缉、缺席审判。无所谓，反正，台湾人没在怕的。”
受访学者认为，这件事的打击面不会仅止于沈伯洋，黑熊学院去年就被列入制裁对象，未来继续受牵连的广度与深度必然会外溢扩散，台湾政府有义务善尽相关损害管制与保护措施。
新华社报道，重庆市公安局星期二发布警情通报称，为坚决打击沈伯洋通过发起、建立台独分裂组织“黑熊学院”等方式从事分裂国家犯罪活动，根据《中华人民共和国刑法》、《关于依法惩治“台独”顽固分子分裂国家、煽动分裂国家犯罪的意见》等有关规定，决定对沈伯洋立案侦查，追究刑事责任。
大陆国务院台湾办公室发言人陈斌华也指出，沈伯洋发起、建立“台独”分裂组织，大肆宣扬“台独”分裂谬论，长期从事分裂国家犯罪活动，是不折不扣的“台独”顽固分子，公安机关对其立案侦查是反对“台独”分裂、维护国家统一的正义必要之举。
国台办2024年10月14日已将沈伯洋列入台独顽固分子清单；今年6月5日，国台办再禁止沈伯洋的父亲沈土城的兆亿公司与大陆企业贸易往来、业务合作，谋取经济利益。
台湾陆委会则严厉谴责中共以内部法令罗织入罪、立案追诉台湾立委的行为，逾越法治文明的底线。
陆委会强调，中共对台完全没有管辖权，其法律与规范对台湾人毫无拘束力，中共官方透过“惩独”之名遂行“跨国压迫”，妄图达到分化与威吓台湾内部的目的不会得逞。
陆委会提醒台湾民众，中共宣布惩戒台湾人士，并鼓励民众举报，对于两岸交流往来大幅提高不可预期的风险；呼吁民众勿为一己私利，配合中共从事违法行为。
民进党也声援沈伯洋，斥責大陆官方此举是“赤裸裸的红色恐怖”，不仅严重破坏两岸关系，更威胁区域和平稳定。
中华战略学会资深研究员张竞接受《联合早报》访问表示，大陆司法制裁不会仅限于沈伯洋一人，包括先前针对台湾资通电军、军事情报局以及心战大队发动司法调查与制裁行动，公布相关人员身份基本资料，“就是要断他们的生路，压缩未来就业空间”。
张竞指出，大陆国台办2024年10月14日将沈伯洋列入台独顽固分子清单，同时也对“黑熊学院”实施惩戒，故该院受训课程学员恐怕是后续外溢扩大被株连对象，他们的个人资料是否被拿去卖给中共，或不排除学员在压力下相互出卖，不利未来赴大陆工作或就学，一般企业也不敢任用。
